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Perl est un langage de programmation créé par Larry Wall en 1987 et reprenant des fonctionnalités du langage C et des langages de scripts tels que sed, awk et shell.

Larry Wall donne deux interprétations de l'acronyme PERL :

• Practical Extraction and Report Language (ou langage pratique d'extraction et de génération de rapports)
• Pathetically Eclectic Rubbish Lister (ou collectionneur de déchets pathétiquement éclectiques), ce second acronyme ayant un but humoristique comme pour le langage LISP (Lots of Insipide and Stupid Parenthesis)

• Introduction au Langage
  • application directe du cours 1
  • application directe du cours 2
  • proteins.fasta (fichier de travail)
• Guide Pratique de Référence de Perl

• TD 1
• TD 2
• TD 3
• TD 4
• TD 5 (BioPerl et petit cours BioPerl)

• Sujet de projet 2007/08
  • fichier de données (PDB) : 1ur5
  • début du code projet

Vous trouverez ici l'ensemble des fichiers ou documents annexes dont vous aurez besoin lors des cours et TD/ED :

• lte3_files.tgz

Vous trouverez ici des documents pour approfondir le cours :

• Tuteur de Gilles Hunault
• Introduction à Perl
• Autre Introduction à Perl
• Expressions régulières

Vous trouverez ici des liens en rapport avec le cours :

• ActiveState (Perl pour Windows/Linux/Mac)
  • ActivePerl Windows Installer
  • Active Perl Symbols
  • Active Perl.zip
• Perl quick reference card (John Bokma)
• www.perl.org
• CPAN (Comprehensive Perl Archive Network)
• perl (en français)
• perl mongers (groupes d'utlisateurs)
• BioPerl
• BioPerl (Cours, exemples et exercices)

• Mastering Perl for Bioinformatics, O'Reilly, First Edition September 2003 , pages: 396, ISBN 10: 0-596-00307-2 | ISBN 13: 9780596003074