1taq - reference 1
Name Taq DNA polymerase
Number of sequences 5
Alignment Length 950
Longest Sequence 928
Shortest Sequence 806
Average Percent Identity 40
Maximum Percent Identity 50
Minimum Percent Identity 35
Sequence Name SWISSPROT Accession
dpo1_thefl P30313
dpo1_myctu Q07700
dpo1_bacca Q04957
dpo1_strpn P13252
DPO1_ECOLI P00582
Family dpo1_thefl dpo1_myctu dpo1_bacca dpo1_strpn DPO1_ECOLI
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DPO1_ECOLI 192 GVPGVGEKTAQALLQGLGGLDTLYAEPEkiaglsfrgaktMAAKLEQnke
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dpo1_bacca 219 mallskk.LAAIRRDAPVElslDIADYQGEDREKVVALFKELGFQSFLEK
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DPO1_ECOLI 242 vaylsyq.LATIKTDVELEltcEQLEVQQPAAEELLGLFKKYEFKRWTAD
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dpo1_myctu 269 Lf..dtlaaaggpevdeg................fdvrgalapgtvrqwl
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DPO1_ECOLI 291 Veagkwlqakgakpaakpqetsvadeapevtatvisydnyvtildeetlk
dpo1_thefl 279 .........gaflgfsfsrpepmwaelLALAGAW...egrlh.ra.....
dpo1_myctu 301 aehagdgrragltgvvgth.lphggdaTAMAVAAadgegayl.dtalt.p
dpo1_bacca 287 adrvteemladkaalvvvv.eenyhdaPIVGIAVvnehgrfflerpet.a
dpo1_strpn 288 adqisqdmlseesifhfelfgenyhtdNLVGFAWscgdqlyatdke...l
DPO1_ECOLI 341 awiaklekapvfafdtetdsldni.saNLVGLSFaiepgvaayipvahdy
dpo1_thefl 311 .qdp.......lrglrdl......kgvrgilAKDLAVLALREGLDLf.pe
dpo1_myctu 348 dddaa......laawladpt...akpkalheAKAAVHDLAGRGWTLegvt
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DPO1_ECOLI 390 ldapdqisreralellkplledekalkvgqnLKYDRGILANYGIELrgia
dpo1_thefl 346 dDPMLLAYLLdpsn..ttpegvarryg.......................
dpo1_myctu 389 sDTALAAYLVrpgqsfrtlddlslrylrelraetpqqqqlsllddddrt.
dpo1_bacca 375 fDLLLAAYLLdpaq...gvddvaaakmkqyeavrpdeaavygkga.krav
dpo1_strpn 374 fDIRLAKYLLstv.....edeniatiaslygqtlvddetfygkgvykkai
DPO1_ECOLI 440 fDTMLESYILnsva...grhdmdslaerwlkhktitfeeiagkgknqltf
dpo1_thefl 371 .....gewtedageRALLAERLFQTLKERLkgeerlLWLYEEVEKPLSRV
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dpo1_strpn 419 p...erekflehlaCKLAVLVETEPILEKLsengqlLELLYDMEQPLAFV
DPO1_ECOLI 487 nqialeeagryaaeDADVTLQLHLKMWPDLqkhkgpLNVFENIEMPLVPV
dpo1_thefl 416 LARMEATGVRLDVAYLQALSLEVEAEVRQLEEEVFRLAGHPFNLNSRDQL
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DPO1_ECOLI 537 LSRIERNGVKIDPKVLHNHSEELTLRLAELEKKAHEIAGEEFNLSSTKQL
dpo1_thefl 466 ERVLFDELGLPai.gKTEKTGKRSTSAAVLEALrea..hPIVDRIL.qYR
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dpo1_strpn 562 QIAKIQSTyvIGLQDWILA.DGKIHTRYVQDLTQTGRLSSVDPNLQNIPA
DPO1_ECOLI 632 GLAKLKSTytDKLPLMINPKTGRVHTSYHQAVTATGRLSSTDPNLQNIPV
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DPO1_ECOLI 879 QVHDELVFEVHKDDVDAVAKQIHQLMENCTRLDVPLLVEVGSGENWDQAh
Key
alpha helix RED
beta strand GREEN
core blocks UNDERSCORE
You can also look at the alignment in RSF format, or MSF format
with a Feature Table
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